Тибетский религиозный деятель, автор большого количества богословских трудов, в т.ч. знаменитого «Большого руководства к этапам Пути Пробуждения». Предписал монахам вновь носить желтые шапки, как символ чистой нравственной дисциплины, ввел строгие правила, обогатил обряды ламаизма, возродил и переосмыслил почитание Будды грядущего (Майтрейи), восстанавливал его статуи, построил монастырь в честь Майтрейи. К основанной (возрожденной?) им традиции (школе) Гелугпа (Желтые Шапки) относится и нынешний Далай Лама.

В жизнеописании Цонкапы есть сюжет Преображения: Однажды утром, одевшись в полную монашескую одежду, Цонкапа уселся в позе ваджры. Руки сложил в мудру дхьяны и погрузился в созерцание на 25 дней. Выйдя из него, он излучал свет, нестерпимый для глаз. Все окружающие были очень удивлены. Кто-то видел светло-желтый свет, некоторые – оранжевый, другие – золотистый. Цонкапа поведал, как можно оказывать помощь людям: «Когда при созерцании возникает искреннее желание, чтобы они обрели счастье, вообразите в уме различные виды счастья и даруйте их существам».